“要和我签订灵魂契约，成为我的舰娘吗？” “不要。” “为什么？” “我是被废弃的废弃舰娘。” “巧了，我是没有指挥资格的指挥官。” “没指挥资格也想成为我的指挥官？” “好吧，其实我是东煌的指挥官学院的高材生——” “学院的高材生和我这个废弃舰娘签什么契约？” 在拥有心智的舰娘被认为是“变异体”而后被控制与消灭的年代，人类与变异体之间的矛盾越发严重。 最终在超稀有舰娘第一次问世之后，这个矛盾被推向了不可挽回的末端。 强大的兵器不应有自我的意志，抹除超稀有舰娘心智的实验被提上日程。 但！ ——即使是兵器，也应该有用自由的意志！ 变异体们发出被压抑许久的怒吼，日趋不满的怒火被彻底点燃。 人类与变异体之间的战争在“和平年代”开始了。 …… 真正的和平究竟何时才会到来？ 世间所有的相遇都是久别重逢。 迷路许久的她们终会再次找到自己的指挥官。 …… “愿胜利为您加冕，指挥官。”